Na podstrani Načini naselitev so obširno predstavljeni viri in poti naselitev tujerodnih vrst v Slovenijo. Na tej osnovi lahko tujerodne vrste razdelimo v tri skupine: 1. Vrste, ki so bile namerno vnesene v državo in so bile naseljene v naravo ali pa so pobegnile iz ujetništva. 2. Vrste, ki so bile nenamerno vnesene kot škodljivi organizmi ali slepi potniki v uvoženem blagu. 3. Vrste, ki so se razširile v Slovenijo zaradi odstranitve geografskih ovir ali kot posledica spontanega širjenja iz sosednjih držav.

1. Pri namernih naselitvah tujerodnih vrst, človek od vnosa živali pričakuje določeno korist. Vrste, ki so naseljene v naravno okolje, so namenjene predvsem lovu in ribolovu, zato ni presenetljivo, da je med njimi največ sesalcev in rib (npr. jezerska zlatovčica (Salvelinus umbla), muflon (Ovis musimon), alpski kozorog (Capra ibex)). V Sloveniji je bilo, v primerjavi s sosednjimi državami, malo naselitev tujerodnih vrst ptic (npr. fazan (Phasanius colchicus)). Nekatere vrste pa so bile namerno vnesene v državo za namene gojitve in so bodisi pobegnile iz ujetništva ali pa so bile ob propadu gojitvenih obratov izpuščene v naravo (primeri: nutrija (Myocastor coypus), pižmovka (Ondatra zibethicus), pa tudi metulj jamamaj ali japonski prelec (Antheraea yamamai).

2. Med nenamerno naseljenimi živalskimi vrstami je veliko škodljivih organizmov,  predvsem žuželk. Te vrste nezaželeno prihajajo v državo kot paraziti, škodljivci ali zajedavci na rastlinah ali živalih ali v izdelkih iz njih. Ker te vrste pogosto povzročajo ekonomsko škodo, predvsem v kmetijstvu in gozdarstvu, so danes vzpostavljeni mehanizmi za zgodnje odkrivanje teh vrst. Kljub temu v Sloveniji beležimo številne žuželke, ki so lahko sicer primarno škodljivci na kmetijskih rastlinah (npr. koruzni hrošč (Diabrotica virgifera), lahko pa ogrožajo tudi domorodne vrste (račja kuga (Aphanomyces astacii). V tej kategoriji pa je še ena pomembna  skupina organizmov, to so živalske vrste, ki prihajajo v Jadransko morje z balastnimi vodami ali potujejo kot pritrjene živali na trupih ladij.